Vorgeschichte nicht ganz nach den Filmen

Als Kind trifft der gut situierte Junge Charles Xavier auf das blaue Wesen Raven, dass die Gestalt verändern kann. Seither leben die Beiden als Bruder und Schwester zusammen. Zur gleichen Zeit lernt Erik Lehnsherr in einem Konzentrationslager Sebastian Shaw kennen, der ihn und seine Fähigkeit für seine Zwecke nutzen will. Jahre später, in den 60er Jahren, treffen Erik und Xavier aufeinander. Gemeinsam gründen sie ein Institut, in dem sie jungen Mutanten helfen wollen, mit ihren Fähigkeiten zu leben. Sie versammeln eine Gruppe von Mutanten um sich, die ihnen helfen sollen, einen Nuklearkrieg zu verhindern. Erik sinnt jedoch auf Rache an Shaw, der ebenfalls Mutanten um sich versammelt hat. Es kommt zum Krieg zwischen den Lagern, bei denen auch die Menschen miteinbezogen werden. Xavier, der mittlerweile als Professor X bezeichnet wird und Erik, der als Magneto seine Fähigkeiten nutzt, entzweien sich und vertreten fortan die eigenen Interessen.
Nun sind einige Jahre ins Land gezogen. Professor X und Magneto haben sich kaum verändert. Jedoch kommen immer neue Mutanten in ihre Lager. Professor X gründete seine Schule für „Talentierte“ während Magneto darauf sinnt die Menschen zu vernichten und die Mutanten an die Macht zu führen.